Sergi Zauner se doctoró en Musicología por la Universidad Autónoma de Barcelona con una tesis sobre música litúrgica hispánica del Renacimiento. Después de una breve etapa como profesor en la UAB, desarrolló gran parte de su carrera académica como investigador contratado en la Universität des Saarlandes (Saarbrücken, Alemania). Actualmente imparte docencia en música en el Instituto de Liturgia de Barcelona ad instar Facultatis y en ESADE–Universitat Ramon Llull. Es colaborador del Instituto Cultura y Sociedad (ICS) de la Universidad de Navarra y miembro de la Societat Catalana d’Estudis Litúrgics (Institut d’Estudis Catalans).
Su actividad investigadora se ha centrado en el estudio de la música litúrgica desde la edad media hasta la época moderna, con una atención especial a las prácticas interpretativas, la relación entre música y discurso y la construcción de experiencias sonoras en contextos rituales, desde un enfoque que incorpora perspectivas de los estudios del sonido. Ha participado en numerosos congresos y encuentros científicos de ámbito nacional e internacional, publicando los resultados de su investigación en revistas especializadas y volúmenes colectivos. Ha realizado tareas de descripción y catalogación de manuscritos musicales medievales y ha participado en diversos proyectos de investigación financiados, como Computergestützte Analyse harmonischer Strukturen (Universität des Saarlandes – Universität Erlangen-Nürnberg), Le Lexique musical de la Renaissance (Centre d’Études Supérieures de la Renaissance, Tours) y Prácticas interpretativas en las catedrales hispanas (1563–1833) (Universidad de Navarra).
Combina la investigación académica con la divulgación y el asesoramiento musicológico en el ámbito de la interpretación histórica. Ha colaborado con conjuntos especializados, aportando criterios contextuales e interpretativos para la recuperación de repertorio, y con festivales elaborando programas de mano. Asimismo, ha publicado artículos de reflexión y divulgación con el objetivo de acercar los retos de la investigación musical a un público más amplio. Su mirada, de carácter interdisciplinario, se interesa por explorar y explicar la música como vehículo de construcción de significado y de vínculo cultural.