Criado en la cuenca del Ruhr y junto al lago Constanza, descubrió el contrabajo a los trece años. Tras completar sus estudios secundarios, estudió en Fráncfort del Meno y posteriormente obtuvo una beca en la recién fundada Academia de la Orquesta Sinfónica de la Radio de Baviera bajo la dirección de Lorin Maazel. En Ginebra completó sus estudios con Franco Petracchi, obteniendo el Diplôme de Soliste.
Desde 2004 es solista de contrabajo de la Orquesta Sinfónica de la Radio de Baviera en Múnich y ha actuado en múltiples ocasiones como solista con su orquesta bajo la dirección del antiguo director titular Mariss Jansons.
Como músico de cámara, Philipp Stubenrauch es miembro de varios conjuntos y ha actuado con Maria João Pires, Valery Afanassiev, Baiba Skride y Maximilian Hornung, entre otros. Junto con Wen-Sinn Yang y Hariolf Schlichtig, grabó un CD muy aclamado con nuevas obras de música de cámara de Sofia Gubaidulina.
Comprometido con la formación de jóvenes talentos, desde hace más de 20 años, es profesor de la sección de contrabajos de la Orquesta Juvenil Estatal de Baviera y profesor en la Academia de la Orquesta Sinfónica de la Radio de Baviera. Imparte clases magistrales en numerosas universidades de Europa y Asia y, desde 2023, es docente de la Hochschule für Musik und Darstellende Kunst Stuttgart.
